到朝鲜红军刺杀，和伊藤博文一样，在刚出火车站的时候就被朝鲜红军派出的志士用炸弹炸死。

寺内正毅被朝鲜人当场炸死身亡，彻底打乱了山县有朋对于他身后事的安排，也使得此时由日本陆军主导的大隈重信内阁顿失外援，海军派和护宪派趁机反攻倒算，大有利用政潮夺回权力的趋势。

由于寺内正毅在朝鲜一贯深居简出，他的出行被视为军方的