而对于被大计黜退的官员，依照京察和外察的旧例，永不叙用，同时朱载坖命令吏部尚书杨博，对空缺的职务立即选拔官员补缺，不拘出身，不管是进士举人这样的科举正途出身，还是吏员考选而来的，只要符合条件，都可以选任。

而正在朱载坖与内阁推动大计，准备刷新吏治的时候，从陕西三边和蓟镇发来的塘报使得朱载坖不得不重视起来了，提督陕西三边军务、丰州伯马芳向朱载坖上奏，称套虏最近蠢蠢欲动，眼下陕西三边军储己足，请求朱载坖准允马芳先发制人，打击套虏。

而汪道昆和戚继光也联名向朱载坖陈奏，土蛮部和朵颜三卫再次袭扰蓟辽，请求朱载坖准允蓟辽两镇反击。

事关军国大事，朱载坖立即召集阁臣和兵部、户部堂官商量此事。