总督京营戎政临淮侯李庭竹为征虏后将军，专督粮秣转运，顺宁侯俞大猷总督京营戎政兼提督九门，发蓟镇、辽东镇、大宁镇、昌平镇、真保镇五镇之兵，从京营、亲军诸卫抽调精锐，组成十二万征虏大军，号称三十万，出塞征讨土蛮和兀良哈。

朱载坖在和户部、太仆寺等衙门商量之后，决定从内承运库发帑银二十西万，遍赏诸军，户部尚书刘体乾亲赴京通仓，组织粮秣转运，太仆寺、辽东行太仆寺调拨马匹，补充军用。

朱载坖在给谭纶和戚继光的圣谕中说道：“帑银粮饷，军器马匹，但有所需，奏闻以取，朕竭府库之粮，倾内帑之银，但求一胜！卿等当体朕意也！”

在朱载坖的命令之下，大明的战争机器开始运转起来了，各种军器甲胄，粮秣物资，通过陆路和水路，转运到指定地点。