清太宗，是位比其父更有政治头脑更有眼光的人物。努尔哈赤虽然已接受了佛教的影响，毕竟还没有减损对旧神的信仰，他家中供有“渥辙库”（家内神），每于其前设誓祝祷，态度是虔诚的。[117]皇太极即位后，却说：“所谓萨满书牍者，早有考究，而今荒疏矣。”[118]说明他对萨满神本的内容原是精熟的，大概也信奉过，但是后来却逐渐与它疏远了。这种对萨满教所持的实用态度，与他在政治上除旧布新、仿行汉制，外交上联络蒙古、鼎力攻明的建树是并行不悖的。皇太极在接触汉人文化后，深感自身宗教和习俗的某些落后和不文明。正是基于这一原因，他试图将民间萨满教中保留的某些落后成分作为陋习，竭力革除；同时，还把萨满教中诸多仪式加以修改，力图使它能够以国家的“大礼”而登上大雅之堂。清入关后宫廷的堂子祭祀，就是把原有的萨满教神祇、礼仪，用儒教传统仪制加以改造的产物。

清朝入关，爱新觉罗氏一跃成为全中国的最高统治者，随着等级制度的确立，它与本族下层人民的隔阂扩大了。萨满教仪礼在满洲社会中从此分衍为两支，即以皇室宫殿堂子祭祀为代表的贵族仪礼和普通旗人的民间仪礼。“清室由东北入主中原，所定通礼亦多缘汉制，惟祭天于堂子，祭神于坤宁宫，犹能保存故俗。”[119]清室宫廷萨满教祭祀的中心，首先是堂子祭天。这种往往被认为是“纯满洲”的仪式，其实本身就是满洲萨满教融汇汉文化成分的产物。